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Gromacs中小分子力场拓扑文件的创建

发表于 2017-03-02 分类于 gromacs

李继存老师在其博客上对小分子及非标准氨基酸等力场的构建、转换做了详细的描述，故将其内容搬运整理至此，以作备忘。

发表于 2017-03-01 分类于 cc

最近打算分析一下分子动力学模拟中，蛋白相互作用对不同力场的依赖性。收集资料时发现李继存老师在其博客上对力场的选择及小分子力场的构建、转换做了详细的描述，故将其内容搬运整理至此，以作备忘。关于小分子力场的设定，会在后续文章中进行详细描述。

发表于 2017-02-27 分类于当我没说

最近看了摆渡人，里面一些不错的句子，摘录如下：

发表于 2017-02-14 分类于当我没说

今天是春节假期回来后第一天上班，新学期新起点，希望这学期能够集中精力做出点有用的东西。

发表于 2017-01-13 分类于 python

本文列出了Github上若干个利用网页版微信接口的Python应用，以供查询。

发表于 2017-01-10 分类于 python

将python源码 py 文件打包成可执行文件，需使用pyinstaller或py2exe，前者操作更为便捷，故选择前者。以下为操作步骤:

发表于 2017-01-07 分类于 python

Python2是大多数人接触到的第一个Python版本，伴随着Python3的逐渐成熟，很多优秀的包都转移到Python3的阵营。这就造成一种混乱的局面，可能需要在2.x和3.x之间切换。一种方法是通过PyCharm这样的工具来进行环境的配置，另一种就是暴力的直接安装了。下面介绍暴力安装的方法：

发表于 2017-01-05 分类于 python

　　最近看到Github上一个Python的repo有点意思，欲clone下来试一试，然而却发现是Python3.X版本，于是打算将其修改为Python2.7版本。　　So，新的轮子又产生了。　　下面记录在网上查找到的python2与python3的区别：

发表于 2016-12-31 分类于 Web

　　本文整理了之前在网上看到的部分Markdown语法，本文内容在VS code中进行测试[好像是Github风格]，在Hexo中也许存在差异。

发表于 2016-12-30 分类于 Web

在next主题中直接使用MathJax编辑公式会出故障，因为hexo自带的渲染 hexo-renderer-marked 与MathJax的渲染有矛盾，所以需要先卸载hexo-renderer-marked，然后安装 hexo-renderer-pandoc ：

1 2	npm uninstall hexo-renderer-marked --save npm install hexo-renderer-pandoc --save