永远相信美好的事情终将发生

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  之前一篇文章中,通过计算范德华和静电相互作用,发现amber和namd的计算结果一致。在本文中,将通过namd来对轨迹进行分析,将范德华和静电相互作用分解到受体的每一个残基上,方法相当于将受体分解为单个的残基pdb,分别计算之后再加和。当然,这完全可以由amber的相应模块实现。此处贴出本文章,主要是认为这种实现方式很有趣,如果让我来做的话,我该是要扑街了。

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转自sobereva,原文地址

在较新版本的VMD里,可以使用ambient occlusion(AO,环境光遮蔽)来改进自带的Tachyon渲染器的渲染效果。这可以使体系在光线照射下呈现的阴暗区域柔和、自然地表现出来,丝毫不逊色于用povray渲染,甚至看着更舒服一些。

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by Nan

本教程面向对LaTeX完全无认知无基础的新人。

LaTeX软件的安装和使用

  1. 方法A(自助):在MikTeX的官网下载免费的MikTeX编译包并安装。下载WinEdt(收费)或TexMaker(免费)等编辑界面软件并安装。
  2. 方法B(打包):在ctex.org下载ctex套装(含MikTeX及WinEdt)
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写完之后再检查一遍错别字(当然自己是找不到的),发现写的挺压抑挺黑暗的,挺有意思

  下午来实验室刷知乎刷了半天,计划晚上分析一下最近的计算结果。可是吃完饭再回来却没有任何学习的劲头。那就趁着现在为这段时间做个小总结。
  掐指一算,从清明节(2016-04-05??)到现在(2016-09-25)在新的实验室也快半年了吧,每天感觉挺累,过得浑浑噩噩,却几乎没有进展。虽然同时在做着几个题,然而却没有能顺利完成的,一开始刚来的时候还满怀信心,对新的实验室新的课题志在必得,仿佛立马出文章立马能毕业立马会走向人生巅峰,伴随着时间一天天的流逝,自己的信心也一点点褪去,身体仿佛依靠着惯性在一步步往下走。

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