自由能微扰(FEP)和热力学积分(Ti)计算结合自由能
分子模拟特别是自由能计算,广泛使用于蛋白-配体的结合亲和力预测,以及对基于结构设计的小分子的排序。 基于结构的结合亲和力的理论预测,在先导化合物的确定和优化中发挥着越来越重要的作用。 Rigorous alchemical methods such as Thermodynamic Integration (TI,热力学积分) and Free Energy Perturbation (FEP,自由能微扰) have shown considerable success in making accurate predictions.