Cpptraj计算蛋白的溶剂可及面积

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　　使用cpptraj计算溶剂可及面积(SASA)，有两种个函数，分别是molsurf和surf：

molsurf

1
molsurf sasa1 :1-100 out sasa.dat probe 1.4

　　此方法计算的是absolute surface area(也就是指定区域的整体的表面积，即适用于计算整个蛋白的溶剂可及面积)，无法得到每天原子(残基)对于整体的贡献。

surf

1
surf sasa1 :1-100 out sasa.dat solutemask :1-200 offset 1.4

　　以上命令使用LCPO方法计算残基1-100对于蛋白整体(残基1-200)表面的贡献，单位为\(A^2\)。

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