常用链接-02-DataBases
本文罗列了计算化学生物学领域一些数据库。待续...
蛋白-配体 - pdb-bind:PDB数据库中的复合物及其结合强度 - scPDB:Database of Druggable Binding Sites - BindingDB:结构以及实验确定的结合强度 - DrugBank:靶蛋白及对应的药物分子
虚拟筛选 - ZINC:包含分子的三维结构文件 - PubChem:小分子数据库 - Super Nature II:天然产物数据库(2d结构)
蛋白结构 - SCOP:蛋白质结构分类数据库 - Dali server:提交蛋白结构,会在PDB中搜索相似的蛋白
综合 - openforcefield
已发表论文相关数据 - figshare - mendeley - zenodo - codeocean - osf -